STTII Ambon merupakan lembaga pendidikan tinggi teologi yang berdiri di Provinsi Maluku atas inisiasi putera daerah yaitu, Pdt. Dr. Chris Marantika, Th.D tahun 1990. Setelah mencapai keberhasilan dan berkontribusi pada kebutuhan gereja melalui Seminary Teologi Injili Indonesia Yogyakarta, beliau berinisitif menjangkau pelayanan kepada umat Kristen di Provinsi Maluku. Keinginannya yang begitu kuat dalam memberikan kontribusi bagi kekristenan di tanah Maluku, medorongnya mendirikan Akademi Teologi Injili Indonesia Ambon. Sekolah tersebut dirancang untuk menjadi kepanjangan tangan visi 1:1:1 yang telah dicetuskan. Seiring dengan perkembangan pengelolaan pendidikan, akademi teologi yang telah dirancang berubah bentuk menjadi sekolah tinggi teologi yang seperti induknya di Yogyakarta. Dengan demikan berdirilah Sekolah Tinggi Teologi Injili Indonesia Ambon yang secara independen mengelola pendidikan tinggi. Yayasan Iman Indonesia sebagai penaung dari STTII Ambon memberikan dukungan terus menerus hingga lembaga ini memberkati gereja-gereja di sekitar Provinsi Maluku dan sekitarnya.

Visi STTII AMBON: 

Menjadi Program Studi Yang Menghasilkan Sarjana Yang Berkompetensi Sebagai Penginjil Pengajar Dan Gembala Jemaat.

Misi STTII AMBON:

1. Menyelenggarakan pendidikan teologia yang Alkitabiah untuk memperlengkapi mahasiswa menjadi pendidik, pengkhotbah yang mampu mengjarkan Alkitab secara teologis, serta siap terjun di tengah-tengah masyarakat dan pemerintah untuk menjawab setiap kebutuhan bidang kerohanian.
2. Menyelenggarakan pendidikan teologia yang Alkitabiah untuk mempersiapkan hamba Tuhan yang berkarakter Kristiani dalam pelayanan.
3. Menyelenggarakan pendidikan teologi yang Alkitabiah dan menerapkan strategi pekabaran injil dan pendirian gereja lokal

Sekolah Tinggi Teologi Injili Indonesia Ambon sampai saat ini memiliki jurusan S1 Teologi Kependetan, yang dilaksanakan dalam dua kelas, yakni kelas reguler (on site) dan kelas profesional (on line). Kami tetap berusaha menjaga kualitas dan profesional dalam menjalanakan pendidikan untuk memperlengkapi para mahasiswa dengan teologi Alkitabiah dan kemampuan berkhotbah secara ekspository. Penerimaan Mahasiswa Baru dilakukan dalam dua gelombang, yakni Gelombang I: Januari - April 2025 dan Gelombang II: Mei - Juli 2025.